Genome Medicine Support Technologist（ゲノム検査技師）

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＊　業務範囲・知識

プレアナリシス段階でのDNA品質の評価

固定

パラフィン包埋・薄切

FFPEブロックの保管

核酸抽出と品質評価

FFPEからの核酸抽出

品質確認と評価

核酸品質確認方法

DIN（DNA Integrity Number）

RIN（RNA INTEGRITY NUMBER）

DNA・RNAの分解度（断片化）を10段階でスコア化

断片化されていない状態は高品質を意味する→10

断片化にしたがい数値は小さくなる

DV200

200ヌクレオチド以上のRNA断片の割合

ライブラリ調整の成功の予測となる

70%以上なら高品質で、30%以下の使用は推奨されない

リアルタイムPCR

絶対定量

相対定量

核酸品質評価

核酸濃度の確認

分光高度計（nano drop）で、260nmと280nmを計測

吸光度比260nm/280nmが1.8~2.0なら純度の高いDNAといえる

核酸の断片化の確認

FFPEの場合、DIN値は5以下になることが多いが、品質が悪いとDIN値は低くなる

核酸の濃度の確認

蛍光定量

核酸インプット量またはPCR

増幅時のサイクル数

ライブラリー構築

2200TapeStationで塩基長と濃度を計測する

シーケンスデータの処理・評価